研究发现，基因IPA1发生某种突变后，会使水稻穗粒数和千粒重（一千粒种子的重量）增加，同时茎秆变得粗壮，增强抗倒伏能力．科学家将突变后的IPA1基因导入常规水稻品种，可以使其产量增加10%以上．如图表示培育该水稻新品种的简易流程，请回答下列问题．

（1）与传统的杂交育种相比较，通过基因工程育种具有明显的优势，一方面能 ______ ，另一方面能 ______ ．
（2）图中步骤①是基因工程的核心步骤，其构建“重组质粒”的目的是 ______ ．
（3）限制酶Bam HⅠ的识别序列和切点是-G^↓GATCC-，在土壤农杆菌Ti质粒上有该酶的一个切点．一个Ti质粒分子经Bam HⅠ切割前后，分别含有 ______ 、 ______ 个游离的磷酸基团．Ti质粒被限制酶Bam HⅠ切割后所形成的黏性末端是 ______ ．
（4）步骤④所依据的原理是 ______ ．如在该过程中，愈伤组织在诱导生根的培养基中未形成根，但分化出了芽，其原因可能是 ______ ．